Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms