Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pate1E9Q658 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pate1E9Q658 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pate1E9Q658 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pate1E9Q658 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pate1E9Q658 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pate1E9Q658 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pate1E9Q658 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pate1E9Q658 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms