Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Ccdc71lE9Q4T4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms