Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm20425E9Q035 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms