Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Srp54bE9PXC0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms