Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms