Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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Gm3676D3Z236 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm3676D3Z236 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm3676D3Z236 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm3676D3Z236 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Gm3676D3Z236 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3676D3Z236 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms