Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Kif28pD3YXS5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Kif28pD3YXS5 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Kif28pD3YXS5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Kif28pD3YXS5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms