Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Gm4950D3YUM8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm4950D3YUM8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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