Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm17333C6EQI3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms