Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syce3B5KM66 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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