Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AU015836B2RUM3 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms