Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brpf1B2RRD7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms