Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ssxb8B1AY40 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ssxb8B1AY40 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ssxb8B1AY40 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ssxb8B1AY40 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ssxb8B1AY40 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ssxb8B1AY40 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ssxb8B1AY40 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ssxb8B1AY40 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ssxb8B1AY40 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ssxb8B1AY40 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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