Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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Rtf1A2AQ19 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Rtf1A2AQ19 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Rtf1A2AQ19 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms