Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Syndig1A2ANU3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms