Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ambra1A2AH22 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ambra1A2AH22 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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