Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms