Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm3238W4VSP7 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm3238W4VSP7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 AC154603.2-201ENSMUST00000223896 577 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm3238W4VSP7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms