Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm4T1NXB5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vstm4T1NXB5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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