Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Homer1Q9Z2Y3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Homer1Q9Z2Y3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms