Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cldn8Q9Z260 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn8Q9Z260 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms