Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ilf3Q9Z1X4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ilf3Q9Z1X4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms