Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lgr5Q9Z1P4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms