Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cldn9Q9Z0S7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms