Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnip1Q9WUU8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnip1Q9WUU8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms