Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nek3Q9R0A5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms