Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc6Q9R087 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms