Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prkab1Q9R078 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Prkab1Q9R078 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkab1Q9R078 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkab1Q9R078 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms