Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AmfrQ9R049 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AmfrQ9R049 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms