Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rnf4Q9QZS2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rnf4Q9QZS2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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