Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChmQ9QXG2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChmQ9QXG2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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