Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ptf1aQ9QX98 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms