Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod4Q9JLH8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod4Q9JLH8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms