Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Chrac1Q9JKP8 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Chrac1Q9JKP8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Chrac1Q9JKP8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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