Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gpa33Q9JKA5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms