Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmbr1Q9JIT0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms