Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgpep1Q9ESW8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgpep1Q9ESW8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgpep1Q9ESW8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgpep1Q9ESW8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgpep1Q9ESW8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgpep1Q9ESW8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgpep1Q9ESW8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgpep1Q9ESW8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgpep1Q9ESW8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Pgpep1Q9ESW8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Pgpep1Q9ESW8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Pgpep1Q9ESW8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pgpep1Q9ESW8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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