Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp29Q9ES63 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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