Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hipk3Q9ERH7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms