Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clstn1Q9EPL2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms