Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ftsj3Q9DBE9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms