Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Med27Q9DB40 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Med27Q9DB40 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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