Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
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Cldn23Q9D7D7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Cldn23Q9D7D7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Cldn23Q9D7D7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cldn23Q9D7D7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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