Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm5Q9D6G9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm5Q9D6G9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms