Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PudpQ9D5U5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PudpQ9D5U5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PudpQ9D5U5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PudpQ9D5U5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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PudpQ9D5U5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PudpQ9D5U5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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