Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930564D02RikQ9D4S4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms