Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pabpc6Q9D4E6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pabpc6Q9D4E6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms