Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Syce1Q9D495 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Syce1Q9D495 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Syce1Q9D495 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Syce1Q9D495 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Syce1Q9D495 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Syce1Q9D495 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Syce1Q9D495 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Syce1Q9D495 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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