Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx29Q9D3S3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Snx29Q9D3S3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Snx29Q9D3S3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Snx29Q9D3S3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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